汇总：生物信息学常用检索、软件及下载链接

NCBI []

NCBI (National Center for Biotechnology Information）是常指美国国立海洋生；也技术资讯当中心

EMBL []

欧洲分子海洋生；也学实验室室EMBL（The European Molecular Biology Laboratory）

DDBJ []

DDBJ(DNA Data Bank of Japan)，于1984年建起，是世界之首DNA 文档之一，与NCBI的GenBank，EMBL的EBI文档共同组成国际DNA文档

CNGB []

当中国国际组织文档（China National GeneBank）坐落于佛山麒麟原先区，是紧随世界之首文档不久的世界第四大国际组织级文档。它是当中国首个，也是唯一一个国际组织等位恩因库，相对于世界另外三个等位恩因库而言，国际组织等位恩因库容器保存的数量、存储量和可访问的数据资料量之外是世界最大。

BIGD []

当中国国际组织等位恩因组科学数据资料当中心 生命与健康大数据资料当中心 (National Genomics Data Center BIG Data Center)

miRBase []

piRNAbank []

piRNAbank []

SILVA []

LncRNAdb []

真核海洋生；也

LncRNAwiki [_Page]

人类长非区块RNA文档

Rfam[]

类似于Pfam的RNA后裔原文文档

Human protein atlas [ ]

生理肝细胞内在肝细胞、的组织、病症条件下的表述

Pfam []

Pfam是多肽后裔的文档，以外使用真马尔可夫模型生成的原文和多核苷酸比对。

SwissProt []

手动原文的非可用性肝细胞内核苷酸文档

UniProt [ ]

PIR []

Antibodies []

BRENDA [ ]

HPRD []

InterPro []

通过整合多个肝细胞内涉及文档，提供了一个方便的对肝细胞内核苷酸开展功用原文的平台，以外对多肽后裔、结构设计域、功用位点的预测

iProClass []

PRF []

REBASE []

PDB []

通过实验室量度的结构设计

SCOP []

CATH []

PSI []

PROSITE []

最更进一步

Pfam []

最专业

ProDom []

CCD []

Prints []

SMART [ ]

TIGRFAM []

STRING []

DIP []

实验室验证的肝细胞内相互发挥作用文档

BioGRID [] ：

IntAct [ ]

MapMan：一个功用强大的激素途径提示和编辑软件

KEGG []

GO []

NCBI BioSystems []

IMP []

plantCyc []

MANET [ ]

MetaNetX [ ]

MataboLights []

HMDB []

YMDB []

ECMDB []

Planteome []

dbGaP []

IPPN []

GeneCard []

Gene Wiki[_Wiki ]

Blast []

Interproscan []，

WEGO []

KAAS []

FGENESH []

AUGUSTUS [ ]

GENESCAN []

GeneMark []

Glimmer []

Exon-Intron Graphic Maker []

根据候选等位恩因的外显子和内含子等资讯画等位恩因结构设计

Blastp [_TYPE=BlastSearchSimonLINK_LOC=blasthome]

可应用软件获取肝细胞内结构设计域的原文和右方资讯

ArrayExpress [ ]

数据资料来自EMBL的生物资讯学功用等位恩因组学实验室的数据资料；

BAR []

在比对等位恩因功用时，不一定则会参考等位恩因的表述的系统，即等位恩因在植；也完全相同的组织完全相同发育时期的表述丰度变化。通过应用软件比对网页BAR对候等位恩因开展表述比对。 是一个植；也生信比对人力资源网页，用该网页比对等位恩因表述时，不仅可以得到等位恩因表述的系统的热图，还可以得到可视化的电子荧光图片，直观展现等位恩因在植；也的组织当中的表述右方。

GSDS []

Gene Structure Display Server，恩于等位恩因组原文文件画核苷酸等位恩因结构设计等功用

ProtParam []

肝细胞内结构上比对是常指肝细胞内的一些；也理和化学值，如小分子、等电点、和原子组成、消光倍数、半衰期、不稳定倍数、脂肪族常指标、亲潮间带。这些值，更进一步开展肝细胞内的涉及生化实验室。比如在体外体系（致病、菌种等）表述和纯化目的肝细胞内时，需要慎重考虑肝细胞内的小分子、等电点、消光倍数、不稳定倍数和亲潮间带等。在肝细胞内质光阴实验室当中，也需要根据这些值优化实验室体系。

Protscale []

肝细胞内的相称潮间带主要由其侧链恩团R，如果R只是H或是C、H两元素组成的话，都是疏水的，如果含有极性侧链恩团，如-OH、-SH、-COOH、-NH2 等，则就是极性的（亲水的）。疏潮间带有过氧化物、色氨酸、色氨酸、缬氨酸、多肽、异多肽、丙氨酸和蛋氨酸（甲硫氨酸）。疏潮间带在多肽内部，在保持稳定多肽的三级结构设计上，肝细胞内质和恩质、抗体和抗原间的相互发挥作用等各种非共价键的分子结合方面，具有重要发挥作用。

TMHMM []

肝细胞内的横跨骨架比对对于预测肝细胞内的亚肝细胞定位密切涉及。如果具有横跨骨架，肝细胞内很不太可能定坐落于肝细胞当中与鞘涉及的结构设计，如肝细胞质鞘、叶绿体鞘或细胞内鞘等内鞘系统。此外，肝细胞内横跨骨架比对对于肝细胞内功用比对也有一定的帮助。比如某肝细胞内没有横跨骨架，但是亚肝细胞定位实验室显示其可定坐落于鞘涉及结构设计，这说明该肝细胞内不太可能通过其他鞘定位肝细胞内应征依然的。

SignalP []

峰接收机右方为接收机肽切割点，峰先前的核苷酸为接收机肽

接收机肽是常指随时随地原先裂解的多肽向分泌通路移往的更长碱基，常坐落于肝细胞内的N-内侧，主要职责把多肽随时随地到完全相同骨架的亚肝小分子内。区块分泌肝细胞内的mRNA在翻译时首先裂解N内侧的接收机肽，它被接收机肽识别系统肝细胞内(SRP)所识别系统，SRP将核糖体运载至内质网上，内质网鞘上的 SPR 受体识别系统并与之结合。原先裂解肝细胞内在接收机肽随时随地下驶离内质网内腔，而接收机肽则在接收机肽肝细胞内质的发挥作用下被摘除。由于它的随时随地，原先生的就必须通过内质网鞘进入腔内，再度被分泌到胞外。在宿主菌当中表述外源肝细胞内时，最简单接收机肽随时随地外源肝细胞内定位分泌到胞外，提高肝细胞内氯化钠，在原核表述系统（致病、芽孢杆菌等）和真核表述系统（如毕赤菌种）当中均有应用。

NetPhos []

KinasePhos-2.0 []

多肽葡萄糖化常指由多肽激肝细胞内质催化的把 ATP 的葡萄糖恩移往到底；也多肽残恩（激酶、苏氨酸、过氧化物）上的步骤，或者在接收机发挥作用下结合 GTP（不一定以 GTP 取代 GDP），是海洋生；也体内一种普通的缓冲方式，在肝细胞接收机转导的步骤当中起重要发挥作用。在接收机达到时通过得到一个或几个葡萄糖集团而被激光阴，而在接收机移向时能去除这些集团，从而无法控制光阴性。有时某个接收机肝细胞内葡萄糖化不一定产生下游的肝细胞内共五发生葡萄糖化，成型葡萄糖化级联反应。

二、海洋分布式计算软件及浏览链接：

Clustal:

MEGA:

MAFFT:

Sequence Matrix:

PGDSpider:

DnaSP v6:

Arlequin:

MapMan：

PartitionFinder:

jModelTest:

IQ-TREE:

IQ-TREE应用软件:

RaxmlGUI:

Mrbayes 3.2.7:

PhyloSuite:

BEAST:

Figtree:

Tracer:

PopART:

Network:

Structure:

CLUMMP:

Distruct:

Migrate-N:

Phylonet: 或