Lancet Oncol:肾透明巨噬细胞癌与肥胖悖论相关的转录组特征分析

2021-10-25 14:48:45 来源:
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一.资料比对背景

厌食症与肝透光线粒质腺癌 (ccRCC)的几率增加有关,但厌食症又矛盾地与该的预后更佳有关,其潜在组态尚不明确。现作者对厌食症病变和经常性质形病变在原发和肉瘤周糖类第3组织中的的微血管转化和免疫mRNA第3组不同完成资料比对比对。

本文介绍了遗传物质注记达引起的微环境的不同有助于解释厌食症病变的生存优势(厌食症悖论)。

二.比对报表三.文章讲解1.COMPARZ路由注记、TCGA-KIRC路由注记、MSK免疫病患路由注记资料收集、矫正

在COMPARZ路由注记的453名病变中的,有375名(83%)病变具可用的微阵列资料,病患前BMI量度以及无成果和某种相对生存资料完成比对(注记1)。除119名(26%)过重病变外,来自COMPARZ飞行测试的就此路由注记以外256名(68%)病变(n=256)。

注记1.COMPARZ流行病学飞行测试路由注记的人口病理学和流行病学相似性

TCGA-KIRC路由注记中的的332例病变中的,评核了经肝切除忍术病患的152例(46%)晚期(即AJCC III和IV期)ccRCC病变的流行病学和人口病理学资料(注记2)。在排除59名(39%)过重病变后,之后获取的路由注记以外93名病变(n=93)。

注记2.晚期透光线粒质肝线粒质腺癌TCGA-KIRC路由注记的密切相关和流行病学相似性

从62例MSK周边糖类第3组织路由注记中的完成肝脏切除忍术的非转移性透光线粒质RCC病变中的获取了原发性和周边糖类混合物。在这个路由注记中的,从59名病变的PNN(肝周附近)周边糖类,25名病变的PNA(远离肝周)周边糖类以及55名病变的第3组织中的波形。在排除过重病变之后,就此路由注记以外41名(69%)PNN试样病变, PNA试样为17(68%),试样为37(67%)。从刚开始的203名与会者的MSK免疫病患资料比对人一组中的排除74名(36%)过重病变后,总生存比对的就此路由注记以外129名(64%)与会者(注记3)(n=129)。

注记3. 采用MSK免疫病患的流行病学飞行测试路由注记的人口病理学和流行病学相似性

2.厌食症的肝透光线粒质腺癌病变相较经常性质形的肝透光线粒质腺癌病变总生存期更长

根据KM生存比对,在三第3组中的都发掘出厌食症病变的总生存期更长。在TCGA-KIRC路由注记中的,经分阶段量度仪器后,厌食症病变的某种相对存活期少时经常性质形第3组;在COMPARZ路由注记中的,经IMDC几率高分量度仪器后,胖病变的某种相对存活期也少时经常性质形第3组。在MSK免疫疗法路由注记中的,经IMDC几率高分量度仪器后,BMI与出生率的无相当大不同(如示意图1)。

示意图1.TCGA-KIRC路由注记 (A)、COMPARZ 路由注记(B)和MSK免疫病患路由注记(C)的总生存期

3.COMPARZ路由注记中的厌食症病变具更容易的PFS

对CPMPARZ路由注记KM比对后,KM曲线推断,COMPARZ路由注记中的厌食症病变比经常性质形病变具更容易的PFS。

示意图S1.COMPARZ路由注记中的厌食症病变比经常性质形病变具更容易的PFS

4.使用三线制剂病患,厌食症病变仍具更容易的OS

KM曲线推断了在使用三线半胱氨酸激酶抑制(pazopanib或Sunitinib)的两个病患第3组中的,厌食症病变的OS仅仅较经常性质形病变好。

示意图S2.COMPARZ路由注记使用三线制剂病患第3组的总生存期比对

5.COMPARZ路由注记中的,厌食症与经常性质形的病变mRNA第3组遗传物质相似性普遍存在相当大不同

再来上述比对,作者在三个路由注记中的确认厌食症悖论普遍存在之后,整整在COMPARZ路由注记中的对厌食症和经常性质形病变评核了mRNA第3组学不同。先是做了Hallmark遗传物质集的GSEA比对,比较厌食症病变与经常性质形病变相互间的不同:厌食症病变中的推断氧气、TGF-β、上皮线粒质-间充质转变和微血管转化频率路中相当大上调,提示伤口愈合唯一可的激活(示意图A)。示意图B是对示意图A筛选的几个遗传物质注记达路中的Enrichment plots。

示意图S4.COMPARZ路由注记中的厌食症病变与经常性质形病变的ccRCCmRNA第3组遗传物质相似性普遍存在相当大不同

6.COMPARZ路由注记与TCGA-KIRC路由注记 中的厌食症比经常性质形病变的微血管转化高分高

在GESA衍生的相似性遗传物质集微血管转化高分比较中的,厌食症病变少于经常性质形病变(如示意图2)。

示意图2.COMPARZ路由注记(A)与TCGA-KIRC路由注记 (B)中的厌食症原发病变与经常性质形病变的微血管转化的z score

7.经常性质形与厌食症病变的免疫线粒质一组无相当大不同

对经常性质形(7例)与厌食症(16例)病变的原发的主要免疫线粒质存量均采用流式线粒质忍术完成评核。示意图A推断了厌食症病变与经常性病变相互间的免疫线粒质一组的某种相对不同。示意图B明确推断了厌食症和经常性质形病变T线粒质一组的经年累月水平。发掘出经常性质形与厌食症病变的免疫线粒质一组无轻微不同,免疫线粒质经年累月的相对与BMI无关。

示意图S9.用流式线粒质忍术比对经常性质形与厌食症病变的免疫线粒质一组无轻微不同

8.与经常性质形病变远比,厌食症病变肉瘤周糖类第3组织炎症增加,常常是附近的肉瘤周糖类

在MSK的非转移性ccRCC病变的实用价值路由注记中的,作者分割了20个最相当大的多样的IPA规范路中,这些路中来自于厌食症和经常性质形病变的PNN和PNA试样的比较(示意图A)。厌食症和经常性质形病变的PNN和PNA试样相互间的免疫经年累月(ssGSEA高分)比较(示意图B)。

示意图S5.与经常性质形的病变远比,厌食症病变的肝周糖类推断出炎症和氧气增加

综上,在COMPARZ飞行测试路由注记中的,经过IMDC几率高分调整后,发掘出相较经常性质形病变,半胱氨酸激酶抑制病患提高了厌食症病变的生存率,引人注意是接受sunitinib病患的病变。IMDC几率高分模型还包括的第3组分间接反映宿主心理因素对腺乳癌系统性炎症作用(例如糖尿病,中的性粒线粒质剧增,和血小板剧增症),这些心理因素不太可能也是免疫病患结果和BMI相互间关联组态的状况。发掘出厌食症病变的微血管转化分数少于经常性质形病变,与之前其他的资料比对结果注记明的,参予微血管转化,β-氧化唯一可等等遗传物质的非金属的现象相反。因此,微血管转化的不同可以部分解释厌食症病变接受半胱氨酸激酶抑制病患后的较好预后。

此资料比对为厌食症悖论提供了病理学支持。在患有ccRCC的病变观察到厌食症病变相较经常性质形的病变微环境的不同:引人注意是厌食症病变的的微血管转化增加,但某种相对炎症无轻微不同。世人注意的是厌食症病变的周边糖类推断增加的炎症和氧气状况。透光线粒质腺癌与肉瘤周糖类第3组织微环境的有用电磁力不太可能具流行病学意义,世人进一步资料比对。

原始出处:

Sanchez A, Furberg H, Kuo F, Vuong L, Ged Y, Patil S, Ostrovnaya I, Petruzella S, Reising A, Patel P, Mano R, Coleman J, Russo P, Liu CH, Dannenberg AJ, Chan TA, Motzer R, Voss MH, Hakimi AA. Transcriptomic signatures related to the obesity paradox in patients with clear cell renal cell carcinoma: a cohort study.Lancet Oncol. 2020 Feb;21(2):283-293

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